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為什么醫學影像AI已進入“后深度學習時代”?

作者(zhe):亞峰發布日期:2019-05-22

  “深度(du)學(xue)(xue)習(xi)正走向(xiang)(xiang)兩極化(hua),大部分(fen)研究(jiu)深度(du)學(xue)(xue)習(xi)的(de)人員會偏向(xiang)(xiang)于工(gong)程化(hua),包(bao)括(kuo)建立更加(jia)全面、便捷、快速(su)、可(ke)視化(hua)的(de)深度(du)學(xue)(xue)習(xi)平臺,'暴力'地將深度(du)學(xue)(xue)習(xi)應用到更加(jia)多的(de)領(ling)域。小部分(fen)的(de)深度(du)學(xue)(xue)習(xi)研究(jiu)者會偏向(xiang)(xiang)于理(li)論化(hua),解(jie)決深度(du)學(xue)(xue)習(xi)的(de)理(li)論瓶頸(jing)包(bao)括(kuo)可(ke)解(jie)釋性等問題。”

  密歇根州立大(da)學(xue)湯繼良教授曾如(ru)此(ci)總結(jie)到。

  醫(yi)(yi)療(liao)AI熱潮,無疑離不開這波深度(du)學(xue)習(xi)(xi)的(de)(de)發展,但由于(yu)深度(du)學(xue)習(xi)(xi)的(de)(de)天然局限性和醫(yi)(yi)療(liao)領域的(de)(de)特殊性,使得醫(yi)(yi)療(liao)AI這一交叉的(de)(de)領域,也(ye)在進入瓶頸(jing)期。

  隨(sui)著深度(du)學習即(ji)將(jiang)觸及天(tian)花板,醫(yi)學影像分析(xi)科研(yan)人(ren)員也隨(sui)之(zhi)分為兩(liang)大派(pai)別:理論派(pai)和(he)工程派(pai)。

  理論派的(de)(de)(de)初衷,是(shi)解(jie)決深度學(xue)習(xi)“短缺”的(de)(de)(de)部分,強調人(ren)工(gong)設計和數(shu)學(xue)論證,通過預先構建先驗知(zhi)識,在不過度依(yi)賴大數(shu)據的(de)(de)(de)前(qian)提下,開(kai)發出一個可解(jie)釋的(de)(de)(de)、高(gao)精度、可解(jie)決諸多長尾問(wen)題(ti)(ti)的(de)(de)(de)“智能(neng)(neng)模(mo)型”。不少(shao)專家認為,醫療AI中有(you)大量Mission Critical和長尾問(wen)題(ti)(ti),這對研(yan)究人(ren)員的(de)(de)(de)整體系(xi)統設計能(neng)(neng)力要求非常高(gao),因(yin)此人(ren)的(de)(de)(de)作用(yong)就顯(xian)得(de)尤為重要,而基(ji)于黑(hei)箱統計模(mo)型的(de)(de)(de)深度學(xue)習(xi),顯(xian)然存在太多的(de)(de)(de)弊病(bing)。

  工程派(pai)的(de)做法,則是進一步發揮深度(du)(du)學(xue)習自(zi)身(shen)的(de)優勢,揚長避短,獲(huo)取(qu)更(geng)多標注數(shu)據,設置更(geng)多參數(shu),用(yong)更(geng)強(qiang)大的(de)算力,訓練(lian)出一個(ge)能夠學(xue)習更(geng)多維度(du)(du)特征(zheng)的(de)“經驗(yan)模型(xing)”。其(qi)本質是建立某種(zhong)學(xue)習和搜索(suo)的(de)Meta Method,依靠(kao)摩(mo)爾定(ding)律帶來(lai)的(de)指(zhi)數(shu)增長的(de)算力,讓機器自(zi)行構建復(fu)雜的(de)知識系統。

  前者強調人工設計(ji),后者依靠機器自主構(gou)建。

  后深度(du)學習時代的醫療AI研究走向(xiang),正朝著這兩個看似(si)極(ji)端的方向(xiang)發展,工者(zhe)愈工,理(li)(li)者(zhe)愈理(li)(li)。

  前者的(de)(de)難度(du)在于(yu)理論(lun)的(de)(de)突破(po),從某(mou)種程度(du)上取決于(yu)個別人的(de)(de)開創性(xing)研(yan)究成(cheng)果;而后者在很大程度(du)上取決于(yu)整個行(xing)業(ye)的(de)(de)數據標準化、開放化和監管進(jin)度(du)。

  二者(zhe)雖殊途,但目的是同歸。

  深度學習(xi)+醫學影像(xiang)的瓶頸

  電子科技大學(xue)教(jiao)授李純(chun)明曾在(zai)接(jie)受雷鋒網(公眾(zhong)號(hao):雷鋒網)AI掘金志(zhi)采訪時談到,深(shen)度學(xue)習吸引(yin)人的(de)地方(fang)在(zai)于,原則上它(ta)在(zai)不同的(de)應用中均(jun)可(ke)以使用同樣的(de)訓練算法框架。

  只需替換訓(xun)練數(shu)據和相應的(de)標注進行訓(xun)練,即可得(de)出一個具(ju)有某種輸入輸出關(guan)系的(de)多層神經網(wang)絡。

  輸入一個數據,系(xi)統就輸出(chu)一個結果,應用過程可以做到全自動。

  但(dan)這種看起來一勞永(yong)逸(yi)的(de)框(kuang)架,在(zai)實際應用中(zhong)還有一些局限。

  以醫(yi)學(xue)影(ying)(ying)(ying)像(xiang)(xiang)(xiang)分析(xi)為例,由于醫(yi)學(xue)影(ying)(ying)(ying)像(xiang)(xiang)(xiang)數據復雜多變(bian),不同(tong)器(qi)械商的(de)(de)(de)成(cheng)(cheng)像(xiang)(xiang)(xiang)設備(bei)(bei)、不同(tong)的(de)(de)(de)成(cheng)(cheng)像(xiang)(xiang)(xiang)參數選擇、成(cheng)(cheng)像(xiang)(xiang)(xiang)設備(bei)(bei)的(de)(de)(de)更新換(huan)代(dai)等(deng)因素,都會導(dao)致(zhi)圖(tu)像(xiang)(xiang)(xiang)性(xing)質(如信(xin)噪(zao)比、分辨(bian)率和偽影(ying)(ying)(ying)等(deng)等(deng))的(de)(de)(de)變(bian)化,以及(ji)不同(tong)病人與病情的(de)(de)(de)差異也(ye)會導(dao)致(zhi)圖(tu)像(xiang)(xiang)(xiang)特征的(de)(de)(de)變(bian)化。

  訓練數據(ju)如果不夠“大而全”,一旦遇(yu)到跟訓練數據(ju)有一定差(cha)異(yi)的(de)數據(ju),加入一點噪音,神經網(wang)絡(luo)輸出的(de)結果可(ke)能就會(hui)出很大的(de)錯(cuo)誤。

  但訓練數據要(yao)多(duo)“大”多(duo)“全”?也并未有一個客觀的量化標準。

  深度學習需要(yao)(yao)用(yong)醫生手工標注(zhu)的數據,還(huan)要(yao)(yao)求(qiu)訓練數據和手工標注(zhu)符(fu)合一定的標準。

  但(dan)數據(ju)的標(biao)準化,還尚未提出通用的法則遵(zun)循。而在(zai)算法層(ceng),深度學習的調參也(ye)并(bing)沒有規律可循,調參難題至今未得到(dao)實質性(xing)解決。

  這些都可(ke)能(neng)(neng)會(hui)(hui)給深度學習的應用帶來(lai)諸多(duo)不(bu)(bu)確定性(xing)(xing),致(zhi)使其在(zai)不(bu)(bu)同數據(ju)集上的性(xing)(xing)能(neng)(neng)可(ke)能(neng)(neng)會(hui)(hui)截然不(bu)(bu)同,魯(lu)棒性(xing)(xing)較差。

  在醫療領域的(de)(de)應(ying)用上(shang),深度(du)學習的(de)(de)不可解釋性也是個無法回避的(de)(de)問題。

  醫生和(he)病(bing)人都(dou)很難接受這種不可(ke)(ke)解釋(shi)的(de)(de)診斷結果和(he)治療方案,而(er)當(dang)前工科會(hui)議(yi)的(de)(de)論文(wen),基于不可(ke)(ke)解釋(shi)的(de)(de)深度(du)學習研究成果幾(ji)乎是主流。

  “數據驅動的(de)深度學(xue)習只是數據處(chu)理的(de)工具之一,它在(zai)醫療領(ling)域(yu)離真(zhen)正的(de)落地(di)還(huan)有(you)相當大(da)的(de)距離,還(huan)需(xu)在(zai)理論和技術上有(you)所突破。學(xue)術界研(yan)(yan)究深度學(xue)習不應太工程化,應該多研(yan)(yan)究一些基礎性的(de)理論問題,提出更有(you)原創性的(de)算法(fa)。”李純明談到。

  “我(wo)認為(wei),從眼前(qian)來講(jiang),不(bu)應(ying)該(gai)一窩(wo)蜂都用(yong)(yong)數(shu)(shu)據(ju)驅動(dong)的(de)深度學(xue)(xue)(xue)習。一些醫(yi)學(xue)(xue)(xue)圖像算(suan)法(fa)(fa)的(de)開(kai)發也(ye)應(ying)該(gai)針對(dui)不(bu)同(tong)的(de)應(ying)用(yong)(yong),去(qu)設(she)計(ji)不(bu)同(tong)的(de)算(suan)法(fa)(fa),開(kai)發者盡可能在(zai)算(suan)法(fa)(fa)中融入領(ling)域知識,設(she)計(ji)出針對(dui)特定應(ying)用(yong)(yong)的(de)個性(xing)化(hua)的(de)方(fang)法(fa)(fa),而(er)不(bu)是(shi)(shi)對(dui)每個病種都在(zai)TensorFlow或Pytorch等(deng)開(kai)源框架上用(yong)(yong)不(bu)同(tong)的(de)數(shu)(shu)據(ju)進行(xing)訓(xun)練和調參(can)。由于深度學(xue)(xue)(xue)習這種數(shu)(shu)據(ju)驅動(dong)的(de)學(xue)(xue)(xue)習過程(cheng),是(shi)(shi)一種較少利用(yong)(yong)領(ling)域知識的(de)機(ji)制(zhi),因此技術(shu)的(de)開(kai)發也(ye)就幾乎不(bu)需要(yao)開(kai)發者與醫(yi)生的(de)交流(liu)。醫(yi)生在(zai)技術(shu)開(kai)發的(de)過程(cheng)中只起到了對(dui)訓(xun)練數(shu)(shu)據(ju)手工標注(zhu)的(de)作用(yong)(yong),也(ye)就是(shi)(shi)說醫(yi)生被(bei)當作人工智能背后的(de)‘標注(zhu)工人’來用(yong)(yong)。”

  “從長期來講(jiang),數據(ju)為王的醫(yi)學影像(xiang)AI研究方(fang)法(fa),在(zai)未(wei)來遇到(dao)的問題(ti)將(jiang)會越(yue)來越(yue)多。當前多數學者更多停留在(zai)簡單的工程問題(ti),缺乏在(zai)基礎研究上的突破性進展,企(qi)業界的技術(shu)開(kai)發也因此遭遇瓶頸。”

  與此(ci)同時(shi),現在的(de)(de)(de)深(shen)度(du)學習其實是一個有問題(ti)的(de)(de)(de)框架,用大量標注數據做訓練的(de)(de)(de)方法(fa),在過去幾年很成(cheng)功,但在解決(jue)醫療這類擁有諸多“非封閉(bi)”和”長尾”問題(ti)的(de)(de)(de)領域,當前的(de)(de)(de)深(shen)度(du)學習主(zhu)流(liu)研究,并不(bu)代表是正確的(de)(de)(de)方向。

  現階(jie)段,計算機視覺系統是(shi)一個(ge)Training System,而不(bu)是(shi)一個(ge)Learning System,我們需要從Training System變成Learning System,讓機器主動(dong),并結(jie)合數據(ju)的結(jie)構、時間空間結(jie)構去學習,而不(bu)是(shi)被(bei)動(dong)地用人工訓(xun)練來標注它。

  目前(qian)行業(ye)(ye)走(zou)的是(shi)粗放型發展(zhan)路線,是(shi)靠(kao)堆積數據(ju)和(he)計算(suan)資源來換取高性能,這是(shi)資源而不(bu)是(shi)效率的競賽。在大(da)家把醫學影(ying)像分析(xi)聚焦于Data Set的大(da)環境下,雖然在工業(ye)(ye)界已有一(yi)定的成果,但理論派認為(wei),原(yuan)創性技(ji)術(shu)和(he)基礎研究,更(geng)值得(de)工科人去關注和(he)投入。

  AI理(li)論創新之外的解(jie)決方(fang)法(fa)

  正是由于(yu)深度學習遭遇的(de)(de)種種問題,也促使優秀科(ke)學家加大了(le)對基礎理(li)論的(de)(de)研究。

  而另一方(fang)面,在部分臨床問(wen)題中,也可通過(guo)在非技(ji)術(shu)層的(de)行業標準(zhun)構建(jian)等方(fang)法,來逐步推動醫(yi)學影像AI輔助診斷的(de)發展。

  第一步(bu),則需定義好要解決的問題(ti)。

  上(shang)海長征(zheng)醫(yi)院影(ying)像(xiang)醫(yi)學與核(he)醫(yi)學科主任劉士(shi)遠在(zai)2018中國醫(yi)學人工智能大會的(de)演講中指出,現(xian)在(zai)的(de)AI醫(yi)療產(chan)品遇到的(de)首個問(wen)題(ti)便是(shi)實用(yong)性差,如現(xian)在(zai)常見的(de)影(ying)像(xiang)AI產(chan)品大多是(shi)基于單病種圖像(xiang)標注形成(cheng)的(de)模型,尚未符(fu)合(he)臨(lin)床實用(yong)場景(jing)的(de)產(chan)品,而且大多數產(chan)品性能的(de)自報數據(ju)與實際檢測數據(ju)不符(fu),魯(lu)棒性有(you)待提(ti)高(gao)。

  AI產(chan)品往往只是(shi)集(ji)中(zhong)在少數幾個病(bing)種,難以覆蓋全部醫學(xue)影(ying)像(xiang)問題。

  其次,行業現(xian)在普遍缺乏標(biao)準化高質量的訓練數據,國內外雖(sui)然有很多(duo)公開的數據庫,但是存在同質化和人種差異等問題(ti)。

  而且眾(zhong)多(duo)人工(gong)智能(neng)企業和(he)機構采用的(de)訓練數據集(ji)標準多(duo)樣,系統偏差較大(da),行業缺(que)乏醫學圖像和(he)疾病征像的(de)統一認識。

  整個行業的(de)醫療數據保護和(he)監管措施也有一定(ding)的(de)缺失,數據不能被(bei)溯源,缺乏合(he)法性和(he)可分享性。

  同時業(ye)內也缺乏(fa)對數據使(shi)用標準的(de)判斷依據,在現有(you)的(de)法律基(ji)礎上(shang)尋找合規(gui)使(shi)用和(he)分享數據的(de)渠道,也是迫在眉睫的(de)一件事(shi)情。

  劉士(shi)遠建議到,構建標準庫,離不開醫生(sheng)的參與。

  要形成(cheng)與AI研發相關的標準(zhun)和(he)數據(ju),需(xu)要在圖像采集環(huan)節(jie)、標準(zhun)庫構建環(huan)節(jie)、病種(zhong)的分布以(yi)及各(ge)種(zhong)描述術語等層(ceng)面,都(dou)要達(da)成(cheng)一定的共(gong)識。

  2018年9月,國家(jia)頒布了《國家(jia)健康醫療大數據標準、安全和(he)服(fu)務管理辦法(試行)》。此外(wai),在肺(fei)結節(jie)(jie)領域(yu),中檢院肺(fei)結節(jie)(jie)AI檢驗數據庫標定專家(jia)組已經完成(cheng)肺(fei)結節(jie)(jie)標準數據集(ji)建(jian)設。

  這些均為標準的建(jian)設,做好了鋪墊。

  當然(ran),圖像(xiang)(xiang)標(biao)注(zhu)(zhu)環節也存在很多問(wen)題,以(yi)(yi)肺結節標(biao)注(zhu)(zhu)過程為例,其主要(yao)存在以(yi)(yi)下問(wen)題:標(biao)注(zhu)(zhu)者隊伍混亂,資質不一(yi)(yi);圖像(xiang)(xiang)征象(xiang)認識不統一(yi)(yi);圖像(xiang)(xiang)標(biao)注(zhu)(zhu)方(fang)法不統一(yi)(yi);圖像(xiang)(xiang)分割方(fang)法不統一(yi)(yi);圖像(xiang)(xiang)量(liang)化方(fang)法不統一(yi)(yi)。

  據了解,中(zhong)檢院(yuan)在構建肺結節標準(zhun)庫(ku)的過(guo)程中(zhong),從全國招了250名5年以(yi)上經(jing)驗的影像科醫(yi)(yi)(yi)生(sheng)志愿者,對(dui)他們進行(xing)了簡單的測試,使用了30例結節,結果準(zhun)確(que)率(lv)只有30%,說明如果沒有共識和基礎培訓(xun),醫(yi)(yi)(yi)生(sheng)的標注準(zhun)確(que)率(lv)很(hen)低(di),非(fei)影像科醫(yi)(yi)(yi)生(sheng)甚至不(bu)是(shi)醫(yi)(yi)(yi)生(sheng)的準(zhun)確(que)率(lv)更難以(yi)想象。

  而標(biao)注的方(fang)式,有緊(jin)密(mi)包裹法、區域標(biao)注法等,不(bu)同的標(biao)注方(fang)法輸出的結果也不(bu)盡相同。

  “圖(tu)像分割如果(guo)沒有(you)統一(yi)的標準(zhun),結論的差別也會非常巨大。

  還有量(liang)化的方(fang)法,到底是(shi)(shi)測(ce)直徑,還是(shi)(shi)測(ce)體積(ji),還是(shi)(shi)測(ce)質(zhi)量(liang),怎么測(ce),行業都需要形成一致意見。

  在(zai)醫學影像AI模(mo)型檢測階(jie)段,也會存在(zai)生產過程(cheng)不規范,模(mo)型效果和(he)安全性缺乏公正(zheng)評價,缺乏產品(pin)檢測標準庫和(he)評價體系,缺乏相關法(fa)律法(fa)規、質控檢查和(he)管理制度等問題(ti)。

  在AI模型使用階段(duan),受歡迎程度(du),對醫(yi)(yi)生的影(ying)響,過多的假陽(yang)性(xing),倫理和法規,是否匹配(pei)醫(yi)(yi)院和醫(yi)(yi)生的需求(qiu)等問(wen)題也尚待解決。”

  另(ling)外,也需考慮其(qi)他(ta)問題:

  產品應游(you)離于信(xin)息(xi)系(xi)統之外,還是融合于信(xin)息(xi)系(xi)統之內?

  年輕醫生對(dui)AI產品產生依賴之后,是(shi)否會導(dao)致業(ye)務能力(li)下(xia)降?

  數據的(de)(de)倫理(li)和產(chan)品(pin)的(de)(de)倫理(li)問題:數據的(de)(de)倫理(li)就是數據的(de)(de)所有權(quan)(quan)、許可權(quan)(quan)和隱(yin)私(si)權(quan)(quan)都需要制(zhi)定規范,現(xian)在衛計(ji)委已(yi)經發布了相關(guan)標準(zhun)(zhun)和規范。第(di)二個則(ze)(ze)是產(chan)品(pin)的(de)(de)倫理(li)問題,隨著產(chan)品(pin)的(de)(de)逐漸落(luo)地,產(chan)品(pin)的(de)(de)責任和影響都需要倫理(li)的(de)(de)相關(guan)準(zhun)(zhun)則(ze)(ze)來考慮。

  劉士遠教授還強調(diao),影(ying)像診斷是全鏈條、多維度的(de)(de)工作,工作內容不(bu)僅(jin)僅(jin)是圖像識別,需(xu)要充(chong)分(fen)發(fa)揮醫生(sheng)在(zai)醫學影(ying)像AI研(yan)發(fa)過(guo)程中的(de)(de)作用。

  在數據(ju)(ju)上(shang),醫生(sheng)可以(yi)建立大樣本(ben)的(de)單病種數據(ju)(ju)庫,提高訓練數據(ju)(ju)質量,并在此(ci)基礎上(shang)規范化標注,形(xing)成高質量訓練集(ji),還要(yao)學會在法(fa)律法(fa)規下(xia)分享和使用數據(ju)(ju)。

  醫(yi)生還(huan)應當成為質量(liang)(liang)控制和(he)標(biao)準的制定(ding)者和(he)執行者。如制定(ding)圖(tu)像采集(ji)和(he)圖(tu)像質量(liang)(liang)的標(biao)準,制定(ding)數(shu)據(ju)庫(ku)建設(she)的構成比例、病(bing)種分布、病(bing)灶(zao)類型等(deng)專家共(gong)識,并形成各單病(bing)種影像征象和(he)描寫屬于以及單病(bing)種AI模型數(shu)據(ju)標(biao)記(ji)專家共(gong)識。建立一套正確(que)的基(ji)本倫理(li)(li)準則來指導AI的設(she)計、管理(li)(li)和(he)應用。

  醫(yi)學影(ying)像AI的(de)未來

  無論是AI理論創新,或(huo)是非理論層的(de)行業標準建立,其(qi)均(jun)是醫學影像AI成(cheng)功的(de)必備條件。

  2019年7月13日,由中(zhong)(zhong)國計(ji)算(suan)機(ji)學會(hui)、雷(lei)鋒網、香港中(zhong)(zhong)文(wen)大學(深(shen)圳)聯合(he)舉辦的CCF-GAIR全(quan)球人工智(zhi)能與機(ji)器人峰會(hui),將開設“AI醫(yi)療”論壇。

  本論壇以“后深度學習(xi)時代的醫療AI”為主題(ti),邀請(qing)全球(qiu)最具代表性的理論派、工程派專家(jia)(jia)以及知名企業家(jia)(jia),在(zai)大會上分享最新醫工交叉與產學融(rong)合研(yan)究成果與應用案例(li)。

  目前,計(ji)算機視覺(jue)與(yu)醫(yi)(yi)學(xue)影像分析界泰斗(dou)級人(ren)物Demetri Terzopoulos院士已確(que)認(ren)出席(xi),與(yu)此同時,雷(lei)鋒網也(ye)在邀請世界級醫(yi)(yi)療(liao)集團(tuan)高管(guan),CVPR、MICCAI等頂會主席(xi)參會。

  在上一(yi)屆CCF-GAIR的醫(yi)療(liao)論壇中,中科(ke)院(yuan)自動化(hua)所研究(jiu)員(yuan)田(tian)捷、飛(fei)利浦(pu)中國(guo)CTO王熙(xi)、MICCAI大會主席沈定剛、微軟(ruan)亞(ya)洲研究(jiu)院(yuan)副院(yuan)長(chang)張益(yi)肇、美國(guo)科(ke)學院(yuan)候選院(yuan)士(shi)邢磊等專家均針對2018年醫(yi)療(liao)AI遇到的難(nan)題,提出(chu)了自己的見(jian)解。

  2019年7月13日,我們將進(jin)一(yi)步(bu)揭開“后深度學習時代”醫療AI的走向(xiang)。

來源:雷鋒網

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