便攜式基因組測序裝置有助監控疫情
本周出版的英國《自然》雜志上發表的一項傳染病學研究論文，描述了一個可以被裝入行李箱并運輸到現場使用的埃博拉病毒基因組測序監測系統，這個系統在收集樣本后24小時內就可以得出結果。該論文還介紹了在西非幾內亞最近的埃博拉疫情中成功使用這個系統進行實時監測疫情的案例。
在監控疫情方面，病毒基因組測序獲取的信息有助于了解病毒在大規模傳播過程中出現了何種變異，這對判斷疫情發展趨勢非常重要。但由于病毒傳播速度快，如何更快、更高效地完成相關分析流程就成為關鍵。
英國伯明翰大學的尼古拉斯·羅曼和他的研究團隊此次開發的基因組監測系統，使用的是一個重量小于100克的DNA測序裝置，可以用標準的航空行李運送，也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團隊使用該系統測序分析了142個從2015年3月份到10月份收集的埃博拉病毒樣本。研究人員發現，他們可以在24小時內得到分析結果，測序過程只需要不到一小時。
在去年埃博拉肆虐期間，該系統曾被率先部署在西非國家幾內亞的一個疫區。研究人員在埃博拉患者身上收集到樣本后，在現場利用這個系統進行病毒基因組測序，無需再把這些樣本長途運回實驗室。
研究團隊認為，這一系統顯示出在資源缺乏的情況下進行實時基因組監控是可行的，并且該設施可以被迅速建立起來以便監測疫情。
報告作者之一、伯明翰大學學者尼克·洛曼說，基因組測序反映的信息在疫情暴發期間對研究人員來說非常重要，以往這項繁瑣工作只能在配備大型設備的實驗室里才能完成，而便攜式測序裝置有望改變這種狀況。
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